多肽在-20℃很穩定，特別是冷凍干燥并保存在干燥器中，在將它們暴露于空氣之前， 冷凍干燥多肽可以放于室溫。
 

　　這將是濕度影響減少，當無法冷凍干燥時，好的方法是以小的工作樣量存放。 對于含Cys, Met orTrP的多肽，脫氧緩沖劑對其溶解不可少，因為這種多肽可易空氣氧化， 在封瓶前，慢慢流過多肽的氮氣或氬氣也會降低氧化作用。
 

　　含Gln或Asn的多肽也容易降解，所有這些肽與不含這些有問題解苷的那些肽相比，生命期有限。
 

　　多肽的保存和操做
 

　　包裝 1mg或更少的多肽按凈重包裝，聲明的小瓶重不含相關抗離子和水。 例如，氨基酸分析決定的肽含量是80%， 在1mg樣品中，那么瓶中毛重是1.25mg。大量的多肽以毛重算。標出的重量含相關抗離子和水， 例如，25mg樣品中肽百分比為90%，那么，實際肽量為25mg×90%=22.5mg，不要把肽含量和純度搞混了。肽的純度可能是100%， 而肽含量相關帶電基團(如Arg, Lys )的抗離子量和肽新水性決定。這是合成肽的本身特性。
 

　　凍干肽的保存
 

　　所有產品應存于冰箱， 最好為-20℃。多數肽以此方法可以存放幾年不變。
 

　　肽溶液的保存
 

　　溶液肽遠比凍干形式不穩定，溶液應為中性pH(pH5-7), -20℃保存的，為避免樣品的反復凍融， 最好分成小樣存放。一份樣品融凍后未用完， 應扔掉，細菌降解有時會成為溶液肽的麻煩， 因此肽應溶于無菌水， 或肽溶液用0.2μ M濾膜過濾。
 

　　多肽應用和保存
 

　　多肽具廣泛的溶解性。多肽不溶的主要問題是形成二級結構。除了最太肽外，這點都會發生， 在有多重疏水殘基的肽中更顯著。鹽會促進二級結構形成。我們建議先在無菌蒸餾水或去離子中溶解多肽。
 

　　如需要增加溶解率， 可用聲處理。溶解仍有問題， 加少量稀乙酸(10%)或氨水，會便于溶解。要長期保存多肽， 最好冷凍干燥，冷干粉可在-20℃或更低存放幾年而很少或無降解。
 

　　溶液中的多肽極不穩定。 多肽易受細菌降解，應用無菌純化水溶解。含有Met, Cgs或Try殘基的多肽溶液由于氧化，壽命有限。應溶于無氧溶劑， 為防止重復凍融的破壞， 建議溶解少量的肽以便實驗，其余多肽以固體形成保存。